Особенности микробиома почв захоронений

Обложка

Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Только для подписчиков

Аннотация

Введение. В Российской Федерации, как и во многих странах, значительные площади отведены под захоронения. В зависимости от химического и биологического воздействия может происходить изменение микробного состава почвы территорий захоронения. На этот процесс влияет множество факторов: влажность, исходное содержание органических и минеральных веществ, уровень кислотности, структура почвы и особенности протекания внутрипочвенных газофазных реакций. Ключевыми участниками процесса разложения органического материала являются бактерии и грибы, многообразие и динамика которых напрямую зависят от степени загрязнения почв поллютантами.

Цель исследования — анализ микробиоты кладбищенской почвы в различных её слоях.

Материалы и методы. Объектами исследования для оценки микробиома почв были кладбища Москвы (Николо-Хованское, Николо-Архангельское, Перепеченское), Московской (Мытищинское, Домодедовское), Тульской (Городское кладбище № 1 МКП КСО, г. Тула), Курской (старое городское кладбище, г. Курчатов) областей, Красноярского (г. Железногорск) и Алтайского (г. Яровое) краёв.

Результаты. Установлено, что наиболее распространёнными в изученных почвах бактериями являются Enterococcus spp. (81%), Bacillus spp. (75%) и кишечная палочка (45,1%). Грибы Penicillium spp. выделены из 61% проб. Выявленные профили микробиоты образцов исследованных кладбищенских почв отражают микробный состав тела человека, что позволяет обосновать основные методы и алгоритм идентификации процессов разложения в зависимости от временных рамок захоронений.

Ограничение исследования. Ограничением исследования является то, что не оценивался риск контакта с кладбищенской почвой, поскольку не все роды выделенных микроорганизмов можно было идентифицировать по их биохимическим свойствам.

Заключение. Исследования, проведённые на территориях кладбищ, показали, насколько разнообразен микробиом почв в местах захоронений и различен в зависимости от глубины отбора проб. Выделенные в ходе исследования профили микробиоты образцов кладбищенской почвы отражают прижизненный микробный состав тела человека, что позволяет обосновать подходы к идентификации процессов разложения в зависимости от временных рамок захоронений.

Соблюдение этических стандартов. Исследование не требовало одобрения локального этического комитета.

Участие авторов:
Ушакова О.В. — концепция и дизайн исследования, написание текста, сбор материала и обработка данных, редактирование, утверждение окончательного варианта статьи;
Рахманин Ю.А. — концепция и дизайн исследования, редактирование, утверждение окончательного варианта статьи;
Евсеева И.С. — сбор материала и обработка данных.
Все соавторы — утверждение окончательного варианта статьи, ответственность за целостность всех частей статьи.

Конфликт интересов. Авторы декларируют отсутствие явных и потенциальных конфликтов интересов в связи с публикацией данной статьи.

Финансирование. Исследования проводились в рамках государственного задания по теме «Мониторинг» в ФГБУ «ЦСП» ФМБА России.

Поступила: 16.04.2024 / Поступила после доработки: 03.06.2024 / Принята к печати: 19.06.2024 / Опубликована: 16.10.2024

Об авторах

Ольга Владимировна Ушакова

Научно-исследовательский институт экологии человека и гигиены окружающей среды имени А.Н. Сысина ФГБУ «Центр стратегического планирования и управления медико-биологическими рисками здоровью» Федерального медико-биологического агентства

Email: Oushakova@cspmz.ru

Канд. мед. наук, вед. науч. сотр. отд. гигиены ФГБУ «ЦСП» ФМБА России, 119121, Москва, Россия

e-mail: Oushakova@cspmz.ru

Юрий Анатольевич Рахманин

Научно-исследовательский институт экологии человека и гигиены окружающей среды имени А.Н. Сысина ФГБУ «Центр стратегического планирования и управления медико-биологическими рисками здоровью» Федерального медико-биологического агентства; ФБУН «Федеральный научный центр гигиены имени Ф.Ф. Эрисмана» Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека

Email: awme@mail.ru

Доктор мед. наук, профессор, академик РАН, гл. науч. сотр. ФГБУ «ЦСП» ФМБА России, 119121, Москва, Россия

e-mail: awme@mail.ru

Ирина Сергеевна Евсеева

Научно-исследовательский институт экологии человека и гигиены окружающей среды имени А.Н. Сысина ФГБУ «Центр стратегического планирования и управления медико-биологическими рисками здоровью» Федерального медико-биологического агентства

Автор, ответственный за переписку.
Email: Ievseeva@cspmz.ru

Канд. мед. наук, ст. науч. сотр. отд. гигиены ФГБУ «ЦСП» ФМБА России, 119121, Москва, Россия

e-mail: Ievseeva@cspmz.ru

Список литературы

  1. Üçisik A.S., Rushbrook P. The Impact of Cemeteries on the Environment and Public Health: an Introductory Briefing. Copenhagen: WHO; 1998.
  2. Eldor A.P., Frey S.D. Soil Microbiology, Ecology and Biochemistry. Elsevier; 2023.
  3. Bourget M.Y., Fanin N., Fromin N., Hättenschwiler S., Roumet C., Shihan A., et al. Plant litter chemistry drives long‐lasting changes in the catabolic capacities of soil microbial communities. Functional Ecology. 2023; 37(7): 2014–28. https://doi.org/10.1111/1365-2435.14379
  4. Valderrama-Beltrán S., Gualtero S., Álvarez-Moreno C., Gil F., Ruiz A.J., Rodríguez J.Y., et al. Risk factors associated with methicillin-resistant Staphylococcus aureus skin and soft tissue infections in hospitalized patients in Colombia. Int. J. Infect. Dis. 2019; 87: 60–6. https://doi.org/10.1016/j.ijid.2019.07.007
  5. Asare M.O., Šmejda L., Horák J., Holodňák P., Černý M., Pavlu V., et al. Human burials can affect soil elemental composition for millennia – analysis of necrosols from the Corded Ware Culture graveyard in the Czech Republic. Archaeol. Anthropol. Sci. 2020; 12(11): 255. https://doi.org/10.1007/s12520-020-01211-1
  6. García-López Z., Martínez Cortizas A., Álvarez-Fernández N., López-Costas O. Understanding Necrosol pedogenetical processes in post-Roman burials developed on dunes sands. Sci. Rep. 2022; 12(1): 10619. https://doi.org/10.1038/s41598-022-14750-5
  7. Krištuf P., Janovský M., Turek J., Horák J., Ferenczi L., Hejcman M. Neolithic long barrows were built on the margins of settlement zones as revealed by elemental soil analysis at four sites in the Czech Republic. J. Archaeol. Sci. 2023; 160(105881): 105881. https://doi.org/10.1016/j.jas.2023.105881
  8. Семенов В.М., Лебедева Т.Н., Зинякова Н.Б., Хромычкина Д.П., Соколов Д.А., Лопес де Гереню В.О. и др. Зависимость разложения органического вещества почвы и растительных остатков от температуры и влажности в длительных инкубационных экспериментах. Почвоведение. 2022; (7): 860–75. https://doi.org/10.31857/S0032180X22070085 https://elibrary.ru/ackyug
  9. Drewnik M., Żyea M. Properties and classification of heavily eroded post-chernozem soils in Proszowice Plateau (southern Poland). Soil Sci. Annu. 2019; 70(3): 225–33. https://doi.org/10.2478/ssa-2019-0020
  10. Tripathi M., Gaur R. Bioactivity of soil microorganisms for agriculture development. In: Microbes in Land Use Change Management. Elsevier; 2021: 197–220. https://doi.org/10.1016/B978-0-12-824448-7.00012-7
  11. Messelhäußer U., Ehling-Schulz M. Bacillus cereus – a multifaceted opportunistic pathogen. Curr. Clin. Microbiol. Rep. 2018; 5: 120–5. https://doi.org/10.1007/s40588-018-0095-9
  12. Майгиер Л., Рахмонов О., Беднарек Р. Особенности почв заброшенных кладбищ северной Польши на песчаных субстратах. Почвоведение. 2014; (6): 759. https://doi.org/10.7868/S0032180X14060082 https://elibrary.ru/sepzwf
  13. Greinert A., Kostecki J. The problem of identifying and classifying post-cemetery soils in urban areas. Geoderma. 2024; 442: 116774. https://doi.org/10.1016/j.geoderma.2024.116774
  14. Charzynski P., Bednarek R., Świtoniak M., Żołnowska B. Ekranic technosols and urbic technosols of Toruń necropolis. Geologija. 2011; 53(4): 179–85. https://doi.org/10.6001/geologija.v53i4.1905
  15. Majgier L., Rahmonov O. Selected chemical properties of Necrosols from the abandoned cemeteries Słabowo and Szymonka (Great Mazurian Lakes District). Bull. Geogr. Phys. Geogr. Ser. 2012; 5: 43–55. https://doi.org/10.2478/v10250-012-0003-8
  16. Żychowski J. Impact of cemeteries on groundwater chemistry: A review. Catena. 2012; 93: 29–37. https://doi.org/10.1016/j.catena.2012.01.009
  17. Ministry of Infrastructure and Development Poland. Regulation of the Minister of Infrastructure and Development of February 27, 2015 on the methodology for determining the energy performance of a building or part of a building and energy performance certificates; 2015.
  18. Forbes S.L., Stuart B.H., Dent B.B. The effect of the burial environment on adipocere formation. Forensic Sci Int. 2005; 154(1): 24–34. https://doi.org/10.1016/j.forsciint.2004.09.107
  19. Ubelaker D.H., DeGaglia C.M. The impact of scavenging: perspective from casework in forensic anthropology. Forensic Sci. Res. 2020; 5(1): 32–7. https://doi.org/10.1080/20961790.2019.1704473
  20. Mou Y., Ye L., Ye M., Yang D., Jin M. A retrospective study of patients with a delayed diagnosis of allergic bronchopulmonary aspergillosis/allergic bronchopulmonary mycosis. Allergy Asthma Proc. 2014; 35(2): e21–6. https://doi.org/10.2500/aap.2014.35.3731
  21. Ярец Ю.И. Патогенный потенциал бактерий группы ESKAPE, выделенных из ран: характеристика фено-и генотипических маркеров и возможность их практического применения. Журнал Гродненского государственного медицинского университета. 2022; 20(4): 400–13. https://doi.org/10.25298/2221-8785-2022-20-4-400-413 https://elibrary.ru/vtsale
  22. Bocchi M.B., Cianni L., Perna A., Vitiello R., Greco T., Maccauro G., et al. A rare case of Bacillus megaterium soft tissues infection. Acta Biomed. 2020; 91(14-S): e2020013. https://doi.org/10.23750/abm.v91i14-s.10849
  23. García-Solache M., Rice L.B. The enterococcus: a model of adaptability to its environment. Clin. Microbiol. Rev. 2019; 32(2): e00058–18. https://doi.org/10.1128/cmr.00058-18
  24. Rezatofighi S.E., Mirzarazi M., Salehi M. Virulence genes and phylogenetic groups of uropathogenic Escherichia coli isolates from patients with urinary tract infection and uninfected control subjects: a case-control study. BMC Infect. Dis. 2021; 21(1): 361. https://doi.org/10.1186/s12879-021-06036-4

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

© , 2025


СМИ зарегистрировано Федеральной службой по надзору в сфере связи, информационных технологий и массовых коммуникаций (Роскомнадзор).
Регистрационный номер и дата принятия решения о регистрации СМИ: серия ПИ № ФС 77 - 37884 от 02.10.2009.